Кишечная палочка была выделена немецким исследователем Эшерихом в 1885 г. сначала из фекалий детей, а затем у взрослых. Эшерих назвал этого микроба Bacterium coli commune. В дальнейшем было установлено, что подобного рода микроорганизмы довольно широко встречаются в природе. Их можно обнаружить в кишечнике почти всех видов млекопитающих, птиц, рыб и рептилий, в воде, почве и других объектах внешней среды. Оказалось, что эти микроорганизмы составляют обширную группу, отдельные виды и разновидности которой наряду с общими сходными признаками имеют и определенные различия по своим биохимическим свойствам и антигенной структуре.