В 1900 г. Флекснер и Стронг во время эпидемии дизентерии на Филиппинах выделили два новых вида бактерий, которые по своим биологическим свойствам отличались от бактерий Шига. Один из этих микробов был назван Bact. dysenteriae Flexneri, другой Bact. dysenteriae Strong. В 1904 г. Гисс и Руссель описали нового возбудителя дизентерии, а в 1917 г. Штуцер в России и независимо от него Шмитц в Германии выделили особого дизентерийного микроба, который отличался по своим биохимическим свойствам от упомянутых бактерий и получил название Bact. dysenteriae Schmitz Schtuzer. Затем Крузе и Зонне также выделили дизентерийных бактерий Bact. dysenteriae Kruse Sonne. В последующие годы был описан еще ряд вариантов, сходных с бактериями Флекснера, в частности бактерии типов New Castle, Denton, типы Бойд Новогородской и др.